Tommy al fin se ha graduado como agente KND. Su primera misión es contra el perverso Padre, quien está convirtiendo a los agentes KND en animales inútiles. Al descubrir que el rayo funciona solo en agentes, hace que los de la otra cuadra se conviertan en animales y, renuncia a la organización para salvarlas de su inminente destino. Esto le costará su permanencia en la organización, aun a pesar de que 2 y 3 desean que vuelva. Pero también hará que se convierta en "El Tommy".