Depuis 2000 ans, le clan de Judas Iscariote, traître de Jésus-Christ, cherche à localiser l'héritage du Christ, mais ne parvient pas à résoudre le mystère. La descendante actuelle, Nova, a réussi à inventer un médicament pour les yeux qui donne le pouvoir de voir à travers n'importe quoi. Elle l'offre à Zenigata et le stimule en lui disant que Lupin ne fera qu'entraver leur mariage. Zenigata est prêt à tout pour l'amour, mais l'objectif de Nova est la moitié du tableau mystérieux, " La Première Cène ", peint par le Christ, qui est en possession de Lupin, après avoir été volé par Lupin I. Le tableau contient une carte cachée qui indique l'emplacement du trésor du Christ.