La stagione ruota attorno a Veronica Mars, una studentessa delle superiori e investigatrice privata nell'immaginaria cittadina costiera di Neptune, nel sud della California. Quando la migliore amica di Veronica, Lilly Kane, viene uccisa, la sua vita va in pezzi. Suo padre, lo sceriffo della contea Keith Mars, accusa il padre di Lilly di essere coinvolto nell'omicidio. Ciò provoca l'ira di Nettuno e la cacciata di Keith da sceriffo in un'elezione di richiamo. La madre di Veronica, Lianne, sviluppa un problema con l'alcol e lascia la città. Gli amici "09er" di Veronica, ricchi studenti del fittizio codice postale 90909, la costringono a scegliere tra loro e suo padre; sceglie suo padre. Keith apre un'agenzia investigativa privata, Mars Investigations, dove Veronica lavora part-time.