След като международен полет 627 каца на летище Логан в Бостън, екипажа и пътниците на който са намерени мъртви от някаква мистериозна и ужасяваща "чума”. Когато партньорът на специален агент Оливия Дънам е заразен с този токсин тя се свързва с д-р Уолтър Бишъп - главен изследовател в областта на така наречената "крайна наука”, и отчуждения от него син Питър Бишъп, в опит да спасят живота му. Те откриват човек, които им дава информация благодарение, на която намират лекарство срещу токсина причинил това. В същото време научават, че тази масова зараза е част от експеримент и от нещо далеч по-голямо, наречено "Схемата”.