Anakin Skywalker og Obi-Wan Kenobi leder en republikansk styrke i et forsøg på at besejre droidehæren og befri planeten Christophsis fra seperatisternes belejring. Da de falder i baghold og er tvunget til at trække sig tilbage, bliver de klar over, at de er blevet forrådt af én af deres egne. Jedi'erne mener at indfiltrationen er en Sith-støttet operation og drager ind bag fjendens linier for at undersøge sagen. Imens forsøger kaptajn Rex og kommandør Cody at finde frem til forrædderen iblandt dem.