In einem anderen Teil der Galaxie setzen sich ein paar Widerstandskämpfer seit Jahren gegen die Metarex zur Wehr. Dr. Eggman gerät zufällig in diesen Krieg und wehrt die Angriffe der Metarex erfolgreich ab. Aus Dankbarkeit wollen die Widerstandskämpfer ihm einen Chaos Emerald schenken. Allerdings befindet sich der auf ihrem verwüsteten Heimatplaneten Cascade. Molly will zusammen mit Shadow und Rouge den Emerald holen. Dabei geraten sie in einen Hinterhalt.