À l'approche d'une nouvelle ère, la ville de Kyoto est dans une situation chaotique. De nombreux clans sont en désaccord et pour s'imposer, ils ont recours à de violentes batailles. Afin de ramener l'ordre dans les rues de Kyoto, une unité de protection, le Shinsengumi a été formée. Composé de jeunes samuraïs, ce groupe va devoir prouver sa valeur afin de ramener la paix. Nous suivons la vie quotidienne pleine d'humour de ce groupe représenté sous forme de personnages en SD.