Malcolm e Stevie hanno intenzione di partecipare a un concorso scientifico creando un nuovo tipo di enzima. Reese si offre di collaborare all'esperimento ma viene sottovalutato da Malcolm. Casualmente si rende essenziale alla riuscita dell'esperimento, ma si scoprirà che tutto era causato alla presenza di asbesto (amianto) nel soffitto. Dewey viene obbligato dai genitori a vendere tavolette di cioccolata porta a porta per la scuola: ci riuscirà ma truffando tutti. Nel frattempo, al Grotto, Francis vuole salvare Ralph, un maialino che deve essere abbattuto.