Черепахи продолжают бороться с, казалось бы, непреодолимой вспышкой мутантов, но они оставляют Донателло под присмотром Эйприл и Кейси, когда он становится очень больным. Однако болезнь Донателло — это не просто простуда; он находится на заключительной стадии вторичной мутации, которая превращает его в дикого зверя, для захвата которого другие черепахи и Кожеголовый должны работать вместе. Тем временем Бишоп поднимает мозг Стокмана со дна Ист-Ривер и воскрешает Стокмана в теле полумонстра-полукиборга.