Dans une colonie pénitentiaire appartenant à la Compagnie des Indes Orientales, Nemo prépare une évasion à bord du sous-marin qu'il a contribué à concevoir avec un ingénieur français. Mais lorsque le directeur Crawley exige que le Nautilus soit déplacé plus tôt que prévu, Nemo doit partir sur-le-champ, avec pour seul équipage les quelques prisonniers se trouvant à bord. Sur leur route, ils percutent un navire et décident de recueillir femmes et enfants, dont la pétillante Humility, qui est fascinée par l'ingénierie depuis toute petite et qui n'a pas l'intention de rester prisonnière du bateau sans rien faire...