Dana Scully különleges ügynök, orvos és a virginiai FBI akadémia oktatója, utasítást kap, hogy jelentkezzen Washingtonban, Scott Blevins aligazgatónál. Blevins beosztja Scullyt nyomozónak az X-aktáknak csúfolt projektbe, a titokzatos és megoldatlan FBI ügyek temetőjébe, amely esetek valamiféleképp kapcsolatban állnak a természetfeletti jelenségekkel. Scully parancsot kap, hogy lépjen kapcsolatba Fox Mulder ügynökkel, akinek szinte rögeszméjévé vált a mások által már szinte elfeledett akták kivizsgálása. Mulder éppen egy különleges gyilkossági ügyben nyomoz.