Reese e Finch scoprono che la Macchina è affetta da un virus che ha compromesso la sua capacità di individuare i prossimi obiettivi. Mentre cercano di trovare una soluzione, sono allo stesso tempo a lavoro per rintracciare un ricco genio della tecnologia che ha fama di essere un eremita. Carter è determinata a mettere le mani sull'assassino di Cal Beecher ma l'organizzazione criminale dell'HR sta seguendo ogni sua mossa.