여행 도중, 특훈을 하고 있었던 지우와 개구마르는 그 곳에서 닌자 트레이너 삼평과 개구마르의 진화형인 포켓몬 개굴반장을 만나게 된다. 지우는 삼평과 포켓몬 시합을 하게 되지만 도리어 지고 만다. 하지만 이 시합에서 상대한 개굴반장의 '전광석화'를 개구마르에게 배우게 하고 싶다며, 삼평에게 '기술의 비법'을 배우기로 한다. 이렇게 해서 지우와 개구마르는 삼평, 개굴반장과 함께 혹독한 수행을 시작하게 된다. 개구마르는 '전광석화'를 배울 수 있을까!?