Będąc ocenianym przez International Oversight Advisory, Richard Woolsey poznaje pięknego naukowca nowego w Atlantis, który nie jest tym, czym się wydaje. Tymczasem podpułkownik John Sheppard zostaje schwytany i torturowany przez wroga, którego myślał, że zabił kilka lat temu: jego zaprzysiężonego wroga, dowódcę Genii, Acastusa Kolię.