Die Humanich-Armee macht sich auf den Weg, um das Versteck der Außerirdischen zu zerstören. Hinter dem Auftrag steckt Shepherd, der nicht an ein friedliches Zusammenleben zwischen Außerirdischen und Menschen glaubt. Während die Roboter viele Außerirdische töten, sorgt das freigelassene Virus für weitere Opfer unter der fremden Spezies. Auch Molly ist infiziert und ihre Verwandlung in einen Außerirdischen ist nicht aufzuhalten.