Conan résout le mystère du pyromane jaune. L'énigmatique Subaru Okiya rend visite au professeur Agasa et lui demande s'il pourrait rester pour loger chez lui, étant donné que son appartement a brulé dans l'affaire précédente. Conan lui propose à la place de loger chez lui, dans la résidence des Kudô, et ce malgré les réticences d'Ai. Peu après, une étrange affaire d'avions en papiers codés attire l'attention de Conan. Il semble cependant ne pas être le seul à travailler sur sa résolution. De leur côté, Ran et Sonoko font la rencontre de Subaru chez Shinichi.