Ppłk Pułkownik John Sheppard jest zapraszany przez Koalicję Planet, aby utworzyć sojusz. Jednak zespół jest wprowadzany w błąd i musi stanąć przed sądem, za swoje rzekome zbrodnie przeciwko galaktyce Pegaza. Ich największą szansą na wolność są doświadczenia Richarda Woolsey`a.